Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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RAB23Q9ULC3 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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RAB23Q9ULC3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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RAB23Q9ULC3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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RAB23Q9ULC3 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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