Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms