Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms