Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms