Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms