Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBH6

XPR1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPR1Q9UBH6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XPR1Q9UBH6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms