Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms