Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms