Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms