Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms