Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST8

CEP89, Centrosomal protein of 89 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP89Q96ST8 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP89Q96ST8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CEP89Q96ST8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CEP89Q96ST8 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CEP89Q96ST8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CEP89Q96ST8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP89Q96ST8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP89Q96ST8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP89Q96ST8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP89Q96ST8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP89Q96ST8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP89Q96ST8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP89Q96ST8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP89Q96ST8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP89Q96ST8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP89Q96ST8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP89Q96ST8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP89Q96ST8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP89Q96ST8 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms