Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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