Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms