Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms