Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms