Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CHST6-201ENST00000332272 7957 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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COPS9Q8WXC6 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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COPS9Q8WXC6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 GNB5-201ENST00000261837 8906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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