Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms