Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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