Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC36A4Q6YBV0 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms