Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC4Q6P4E1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms