Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms