Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYTL3Q4VX76 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms