Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY8

ARL13B, ADP-ribosylation factor-like protein 13B, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL13BQ3SXY8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL13BQ3SXY8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms