Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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GEN1Q17RS7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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GEN1Q17RS7 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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GEN1Q17RS7 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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