Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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