Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms