Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2B3Q16720 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
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