Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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