Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms