Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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SGCBQ16585 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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SGCBQ16585 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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SGCBQ16585 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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SGCBQ16585 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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SGCBQ16585 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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SGCBQ16585 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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SGCBQ16585 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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