Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ACKR1Q16570 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms