Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms