Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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