Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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UBE3CQ15386 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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UBE3CQ15386 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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UBE3CQ15386 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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UBE3CQ15386 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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UBE3CQ15386 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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UBE3CQ15386 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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UBE3CQ15386 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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UBE3CQ15386 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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