Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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SCARF1Q14162 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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SCARF1Q14162 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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SCARF1Q14162 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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