Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms