Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TUBB3Q13509 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TUBB3Q13509 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TUBB3Q13509 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TUBB3Q13509 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TUBB3Q13509 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TUBB3Q13509 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TUBB3Q13509 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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