Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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