Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPAL4Q0D2K0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms