Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms