Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FMODQ06828 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FMODQ06828 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FMODQ06828 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FMODQ06828 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FMODQ06828 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FMODQ06828 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
FMODQ06828 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
FMODQ06828 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
FMODQ06828 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
FMODQ06828 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FMODQ06828 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms