Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALD1Q05682 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms