Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms