Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms