Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GJA9P57773 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GJA9P57773 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GJA9P57773 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GJA9P57773 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJA9P57773 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GJA9P57773 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms