Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ELLP55199 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ELLP55199 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ELLP55199 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ELLP55199 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ELLP55199 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ELLP55199 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ELLP55199 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ELLP55199 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ELLP55199 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ELLP55199 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ELLP55199 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms