Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC109466.1-206ENST00000522686 774 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms