Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
NESP48681 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NESP48681 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NESP48681 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NESP48681 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NESP48681 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NESP48681 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NESP48681 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NESP48681 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NESP48681 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NESP48681 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NESP48681 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NESP48681 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NESP48681 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NESP48681 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NESP48681 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NESP48681 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NESP48681 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NESP48681 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NESP48681 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NESP48681 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NESP48681 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NESP48681 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NESP48681 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
NESP48681 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NESP48681 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NESP48681 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NESP48681 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NESP48681 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NESP48681 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NESP48681 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NESP48681 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NESP48681 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NESP48681 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NESP48681 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NESP48681 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NESP48681 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NESP48681 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NESP48681 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NESP48681 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NESP48681 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NESP48681 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NESP48681 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NESP48681 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NESP48681 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NESP48681 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NESP48681 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NESP48681 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NESP48681 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms