Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms