Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDF5P43026 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDF5P43026 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GDF5P43026 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms